MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 81968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013851	CCG	2	6	67210	67215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939823
1502	NC_013851	GCT	2	6	67230	67235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939823
1503	NC_013851	GGCG	2	8	67272	67279	0 %	0 %	75 %	25 %	288939823
1504	NC_013851	GGT	2	6	67341	67346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939823
1505	NC_013851	CAG	2	6	67372	67377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939823
1506	NC_013851	TGA	2	6	67473	67478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939823
1507	NC_013851	GCCG	2	8	67485	67492	0 %	0 %	50 %	50 %	288939823
1508	NC_013851	GGC	2	6	67506	67511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939823
1509	NC_013851	GC	4	8	67510	67517	0 %	0 %	50 %	50 %	288939823
1510	NC_013851	GCC	2	6	67596	67601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939823
1511	NC_013851	GGC	2	6	67635	67640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939823
1512	NC_013851	CAG	2	6	67669	67674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939823
1513	NC_013851	CGA	2	6	67722	67727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939823
1514	NC_013851	CGGCGC	2	12	67732	67743	0 %	0 %	50 %	50 %	288939823
1515	NC_013851	GCC	2	6	67798	67803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939823
1516	NC_013851	GC	3	6	67900	67905	0 %	0 %	50 %	50 %	288939823
1517	NC_013851	GCG	2	6	67983	67988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939823
1518	NC_013851	ATCCG	2	10	68140	68149	20 %	20 %	20 %	40 %	288939824
1519	NC_013851	TTG	2	6	68171	68176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939824
1520	NC_013851	GGGC	2	8	68241	68248	0 %	0 %	75 %	25 %	288939824
1521	NC_013851	CAGT	2	8	68364	68371	25 %	25 %	25 %	25 %	288939824
1522	NC_013851	CG	3	6	68429	68434	0 %	0 %	50 %	50 %	288939824
1523	NC_013851	GC	4	8	68449	68456	0 %	0 %	50 %	50 %	288939824
1524	NC_013851	TGG	2	6	68457	68462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939824
1525	NC_013851	GCG	2	6	68508	68513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939824
1526	NC_013851	AGG	2	6	68551	68556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939824
1527	NC_013851	TTC	2	6	68621	68626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939824
1528	NC_013851	AGC	2	6	68628	68633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939824
1529	NC_013851	CGA	2	6	68743	68748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_013851	GAC	2	6	68794	68799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013851	GCC	2	6	68805	68810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_013851	CGG	2	6	68821	68826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013851	CTT	2	6	68876	68881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939825
1534	NC_013851	CCG	2	6	68917	68922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939825
1535	NC_013851	GCT	2	6	68949	68954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939825
1536	NC_013851	CGG	2	6	68985	68990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939825
1537	NC_013851	CAC	2	6	69069	69074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939825
1538	NC_013851	GCC	2	6	69075	69080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939825
1539	NC_013851	GTT	2	6	69093	69098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939825
1540	NC_013851	TGA	2	6	69113	69118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939825
1541	NC_013851	GTC	2	6	69201	69206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939825
1542	NC_013851	CAG	2	6	69279	69284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939825
1543	NC_013851	GC	3	6	69425	69430	0 %	0 %	50 %	50 %	288939825
1544	NC_013851	GCC	2	6	69450	69455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939825
1545	NC_013851	GTC	2	6	69543	69548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939825
1546	NC_013851	GC	3	6	69557	69562	0 %	0 %	50 %	50 %	288939825
1547	NC_013851	CAG	2	6	69618	69623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939825
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1549	NC_013851	GGGCT	2	10	69705	69714	0 %	20 %	60 %	20 %	288939825
1550	NC_013851	GGTC	2	8	69730	69737	0 %	25 %	50 %	25 %	288939825
1551	NC_013851	CCGG	2	8	69881	69888	0 %	0 %	50 %	50 %	288939825
1552	NC_013851	TCTG	2	8	69923	69930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_013851	CTG	2	6	69937	69942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013851	TGG	2	6	69983	69988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939826
1555	NC_013851	GGC	2	6	70011	70016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939826
1556	NC_013851	GGGC	2	8	70019	70026	0 %	0 %	75 %	25 %	288939826
1557	NC_013851	TGG	2	6	70049	70054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939826
1558	NC_013851	CTC	2	6	70059	70064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939826
1559	NC_013851	CGCGA	2	10	70077	70086	20 %	0 %	40 %	40 %	288939826
1560	NC_013851	TCG	2	6	70204	70209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939826
1561	NC_013851	CTT	2	6	70227	70232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939826
1562	NC_013851	GCCG	2	8	70256	70263	0 %	0 %	50 %	50 %	288939826
1563	NC_013851	TCG	2	6	70294	70299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939826
1564	NC_013851	GCA	2	6	70314	70319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939826
1565	NC_013851	GC	5	10	70340	70349	0 %	0 %	50 %	50 %	288939826
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1567	NC_013851	CTC	2	6	70506	70511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939826
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1573	NC_013851	TCG	2	6	70771	70776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939826
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1582	NC_013851	GTG	2	6	71059	71064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013851	CAA	2	6	71099	71104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1585	NC_013851	GCCG	2	8	71214	71221	0 %	0 %	50 %	50 %	288939827
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1595	NC_013851	TCG	2	6	71620	71625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939827
1596	NC_013851	CAA	2	6	71645	71650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939827
1597	NC_013851	CCG	2	6	71668	71673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939827
1598	NC_013851	CG	3	6	71701	71706	0 %	0 %	50 %	50 %	288939827
1599	NC_013851	AGC	2	6	71707	71712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
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1602	NC_013851	CGA	2	6	71837	71842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
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1607	NC_013851	CCAAGG	2	12	71977	71988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
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1609	NC_013851	CGG	2	6	72112	72117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1610	NC_013851	CGC	2	6	72149	72154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939827
1611	NC_013851	GTCAAC	2	12	72201	72212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288939827
1612	NC_013851	GGC	2	6	72213	72218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1613	NC_013851	GCCATC	2	12	72219	72230	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288939827
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1615	NC_013851	CGG	3	9	72329	72337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1616	NC_013851	CGT	2	6	72374	72379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_013851	CCG	2	6	72380	72385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_013851	CGG	2	6	72397	72402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013851	CCT	2	6	72409	72414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_013851	GC	3	6	72467	72472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_013851	AGCG	2	8	72524	72531	25 %	0 %	50 %	25 %	288939828
1622	NC_013851	CAT	2	6	72532	72537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939828
1623	NC_013851	AAG	2	6	72539	72544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939828
1624	NC_013851	CCG	2	6	72553	72558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939828
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